金、元时期此处就有建筑,明代在原建筑的基础上修建了寿皇亭,明崇祯末年,皇帝曾在寿皇亭中观看臣子射箭。清代,原建筑损坏。1956年,在原址修建了现在的建筑。《明季北略》中记载:“万岁山之寿皇亭,即煤山之红阁也,亭新成,先帝为阅内操特建者”。
寿皇亭