色吾寺，在日喀则地区之南木林县境内，位于县驻地东北、拉布普乡以北的色吾沟，寺庙距县驻地70公里，海拔4500米。 色吾寺，由证士典尼囊单主持修建，距今已有一千多年的历史。该寺曾有1个大经堂、11个殿堂、一百五十余名僧人，主供莲花生大师。十年浩劫中色吾寺被毁。1984年国家拨款在原寺废墟上修复了大经堂和9个殿堂，供有莲花生师徒三尊塑像，还有空行母益西措杰（原为藏王墀松德赞的妃子，后拜莲花生为师，成为西藏密法史上著名的女密法大师）的修行洞。现有僧人68名、尼姑4人。寺内藏有16件珍贵文物，由证士曲尼囊单从伏藏谷挖掘出的莲花生主尊金铜3像、噶玛巴的鞋、空行母益西措杰的喜金刚橛、莲花生大师的9股金刚杵和5股黑石右旋海螺以及莲花生大师在石头上留下的右手指印。寺庙西南矗立着一座俱德堆宝塔。相传，此塔是从印度运到这里来的，塔内装藏着莲花生大师在石头上留下的左手指印；寺庙北面的南棕山上有3个禅房和修行洞。每年藏历12月22日至30日，该寺要举行跳神（僧人献供时的舞蹈）和驱鬼仪式。 色吾寺地处色吾沟。色吾沟景色优美，满山遍野长满了灌木、花草。周围山峰形态各异，千姿百态，如剑如壁如鸟兽如人物，像一幅美丽的画卷。沟尽头向东南一直延伸到贡嘎山脚下，沟尾向西北一直延伸到朗阿朗穷村，整个沟形如空行母贡都桑姆的生殖器。莲花生大师曾在色吾沟修行过十三年，并在此沟伏藏了许多经、法器、珠宝等，是西藏著名的十三处阴面伏藏谷和八处阳面伏藏谷。因此，此沟是佛教徒心目中的神山圣地。相传，要是能听到色吾沟的名字，就能征得欢喜地（大乘菩萨十地之一地）；能触摸色吾沟的土地、山石、树木，就能消灾避邪。
