全寺布局为其它禅林所少见，天王殿后，大雄宝殿、大悲殿、藏经楼、玉皇殿、方丈室等均在一条平行线上，颇具浙东园林建筑风格。
慧济寺主殿屋顶用天蓝、淡绿、鹅黄、紫红等色琉璃瓦盖成，阳光下映出万道彩虹，形成"佛光普照"的绚丽景象。
慧济寺深藏于林屏之中，游人到达山顶，还见不到寺院踪影，进入一条间嵌莲花石板的通道，两道黄墙夹路曲绕，行不多时，见远处金光闪耀，一座琉璃瓦顶的大寺院出现在眼前。
与普陀山其它寺院不同，主殿大雄宝殿，供奉的是释迦牟尼佛像，两边侍立弟子阿难与迦叶。大殿两厢各塑有10尊塑像，是佛教传说中的“二十诸天”，后两侧供观音及千手观音木雕像。大雄宝殿屋顶全用天蓝、淡绿、鹅黄、紫红等色琉璃瓦盖成，在阳光下映出万道彩虹，形成“佛光普照”的绮丽景观。
慧济禅寺
观音殿新建1989年，殿内汇集了根据唐、宋、元、明、清以来历代画家所绘观音像而镌的石刻观音，共123尊，是普陀山宗教艺术的精华之一。
