如来殿、万佛阁，一底一楼，是智化寺最大的建筑。楼下供奉释迦如来本尊，梵王、金刚相对为侍；楼上供奉毗卢遮那佛、卢舍那佛、释迦牟尼佛。上下两层山墙上，佛龛满布，内有小佛九千九百九十九尊，万佛阁因此得名。其顶部藻井二十世纪三十年代流失美国。
如来殿与万佛阁
